Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PatjQ63ZW7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms