Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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