Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad21Q61550 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad21Q61550 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad21Q61550 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad21Q61550 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad21Q61550 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad21Q61550 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad21Q61550 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad21Q61550 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms