Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vsx2Q61412 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vsx2Q61412 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms