Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usf1Q61069 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usf1Q61069 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usf1Q61069 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usf1Q61069 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usf1Q61069 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usf1Q61069 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usf1Q61069 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usf1Q61069 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Usf1Q61069 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usf1Q61069 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usf1Q61069 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usf1Q61069 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usf1Q61069 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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