Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms