Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod1Q60867 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms