Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfaip3Q60769 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip3Q60769 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms