Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tcf4Q60722 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms