Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms