Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Utp20Q5XG71 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms