Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gprasp1Q5U4C1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms