Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Myh1Q5SX40 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms