Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms