Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctc1Q5SUQ9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms