Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms