Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Psme4Q5SSW2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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Psme4Q5SSW2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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Psme4Q5SSW2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Psme4Q5SSW2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Psme4Q5SSW2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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