Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim58Q5NCC9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms