Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf2Q5NC05 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf2Q5NC05 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms