Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp22Q5DU02 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms