Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf608Q56A10 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf608Q56A10 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms