Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10488Q4KL05 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10488Q4KL05 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10488Q4KL05 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10488Q4KL05 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10488Q4KL05 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10488Q4KL05 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10488Q4KL05 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm10488Q4KL05 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm10488Q4KL05 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms