Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Zfp235Q499D5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Zfp235Q499D5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Zfp235Q499D5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp235Q499D5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Zfp235Q499D5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Zfp235Q499D5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zfp235Q499D5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zfp235Q499D5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zfp235Q499D5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zfp235Q499D5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zfp235Q499D5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp235Q499D5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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