Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap2Q3V1H1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap2Q3V1H1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms