Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skap1Q3UUV5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skap1Q3UUV5 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms