Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28047Q3US59 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28047Q3US59 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms