Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Znf48Q3US17 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Znf48Q3US17 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Znf48Q3US17 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Znf48Q3US17 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Znf48Q3US17 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Znf48Q3US17 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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