Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TceancQ3US16 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms