Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
E130208F15RikQ3UPV3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms