Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl2Q3UMU9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms