Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms