Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smu1Q3UKJ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smu1Q3UKJ7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms