Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Usp19Q3UJD6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Usp19Q3UJD6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Usp19Q3UJD6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Usp19Q3UJD6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Usp19Q3UJD6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Usp19Q3UJD6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Usp19Q3UJD6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Usp19Q3UJD6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Usp19Q3UJD6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Usp19Q3UJD6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Usp19Q3UJD6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp19Q3UJD6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp19Q3UJD6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms