Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc34Q3UI66 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms