Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nkx6-3Q3UHX8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx6-3Q3UHX8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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