Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

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Length 1,954 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Greb1Q3UHK3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Greb1Q3UHK3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms