Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH06

Rreb1, Ras-responsive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rreb1Q3UH06 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rreb1Q3UH06 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rreb1Q3UH06 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms