Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam35aQ3UEN2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam35aQ3UEN2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam35aQ3UEN2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam35aQ3UEN2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam35aQ3UEN2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam35aQ3UEN2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam35aQ3UEN2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam35aQ3UEN2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam35aQ3UEN2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam35aQ3UEN2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms