Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trafd1Q3UDK1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trafd1Q3UDK1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms