Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cops9Q3U898 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms