Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem35bQ3U0Y2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms