Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc28Q3TX51 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms