Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc102aQ3TMW1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms