Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdlim7Q3TJD7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdlim7Q3TJD7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms