Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms