Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrp1aQ2LKU9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrp1aQ2LKU9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrp1aQ2LKU9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp1aQ2LKU9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms