Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim71Q1PSW8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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