Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms