Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Neurl1bQ0MW30 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Neurl1bQ0MW30 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms