Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NeblQ0II04 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms